隨著疫情逐漸受到控制，繼澳門之後，香港也即將採用「健康碼」機制。香港食物及衞生局表示，「港版健康碼」準備工作已大致完成。只要持有效新冠病毒核酸檢測健康證明，便可免檢疫往返粵港澳三地，有意獲取健康碼的人士可經由醫生轉介接受病毒檢測，若檢測結果呈陰性，認可機構會將結果及相關人士的個人資料上載至健康碼系統，申請人可用化驗所紀錄在網上申請健康碼。取得個人健康碼後，可在7日有效期內免檢疫往返粵港澳。申請人通過填報個人資訊健康狀況、旅遊史、居住地、及是否接觸過疑似或確診肺炎病患等問題自動生成二維條碼，分紅、黃、綠三種顏色，動態顯示個人疫情風險等級。
港版健康碼又稱「港康碼」，是病毒檢測證明代替檢疫措施的健康碼系統，可配合粵港澳三地政府文件互認，港人屆時往返三地就不用再接受來回合共長達21天的強制檢疫。「港康碼」只適用於香港，市民要申請到內地或澳門時豁免強制檢疫措施必須要再申請「粵康碼」及「澳康碼」。據指，在香港的申請人於認可機構完成核酸檢測後，機構便會將檢測結果等資料上載到衞生署網站。通過檢測者可在署方網站取得屬於自己的「港康碼」，再藉此申領其他地區的「健康碼」，其間須再填寫一份電子表格，包括姓名、證件號碼、目的地等資料，填妥及驗證完畢後，該電子表格便會轉換成「粵康碼」或「澳康碼」。
澳門版健康碼澳門衞生局介紹指「澳門健康碼」又稱澳康碼共分為三個顏色綠、黃、紅，會依申請人填寫的健康史、接觸史及旅遊史作出評分，如為紅色的居民將會轉送到醫療機構評估，甚至住院，而非澳門居民持紅碼或禁入境；黃碼是請自我健康管理。紅色的人士會完成醫學觀察隔離14天或治療後，系統會自動解除其紅色健康碼。
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